電滲析器在實際運行中常見的故障原因及其處理方法如下：
(1)電滲析器的水壓高、出水量低或水流不暢
故障的原因可能是：
①開車前管路未沖洗干凈，激使雜質堵塞水流通道；
②在組裝時，隔板和膜的進出水孔未對準，或是部分隔板框網收縮變形，或是隔板框和隔網厚度配合不適當；
③級段間的水流倒向時，進出水孔錯位。
上述故障的處理方法是：
①拆開電滲析器清除出水孔、布水槽等處雜物，然后重新組裝，或在進水管道加設過濾器；
③變形的隔板要調換：對隔板加工要注意厚度均勻，與框網厚度的配微要良好；
④對進出水孔錯位，要仔細檢查并重新組裝測試。
(2)電滲析器的除鹽效果差、電流偏低
故障的原因可能是：
①部分陰、陽膜可能裝錯；或是部分濃、淡室隔板裝錯，以及膜破裂；
②電路系統接觸不良，樹脂膜受到污染，性能變壞。
上述故障的處理方法是：：
①重新組裝，并去除已損壞的隔板或膜；
②檢查電路，使接觸良好。定期用酸、堿液對樹脂膜進行復蘇處理。
(3)電滲析器電流不穩、出水流量不穩及壓力表抖動等
故障的原因可能是：
①
電滲析器內的空氣末排盡，或水泵吸口管路漏氣使水漏氣；
②流量計及壓力表離泵出口太近，受水泵沖擊而抖動，或是系統阻力大大。
上述故障的處理方法是：
①設法使裝置內部空氣排盡，修好系統漏氣處；
②改裝流量計和壓力表的位置，并盡力減少系統阻力。
(4)電滲析器的出水水質下降，或是某一段水質特特別差
故障的原因可能是：
①原水預處理效果差，膜堆和極室沉淀結揩垢嚴重；
②某段的樹脂膜破裂，或是濃、淡室間泄漏。
上述故障的處理方法是：
①改進預處理。重新拆開電滲析器，清洗膜、隔板和極框；
②拆開電滲析器檢查，調換隔板和膜。
(5)淡室水質突然下降，電耗增加，轉子流量計上有黃褐色鐵銹
故障的原因可能是：
①個別膜破裂(尤其是靠近極室的膜)，電極腐蝕斷裂，電極接線松動；
②原水含鐵量較多，或管網有腐蝕。鐵溶入水中。
上述故障的處理方法是：
①及時調換破膜或斷極，電極的接觸始終要良好；
②加強原水預處理。管路盡量不使用鐵管，而要有防腐措施，開車時管網存水要排放干凈，受鐵污染處要及時清洗。
(6)電滲析器本體漏或變形
故障的原因可能是：
①組裝時螺桿未擰緊；
②隔板邊框夾有雜物和隔板破裂，或是隔板和膜厚薄不均勻；
③開車時速度過快，電滲析器驟然升壓，使隔板受沖擊而變形，或停車過速，使失壓過快，膜堆也會變形。
上述故障的處理方法是：
①檢查和擰緊螺桿；清除邊框雜物或調換破裂隔板，在漏水處墊以石棉繩或塑料薄片后重新擰緊；
②開車時要緩慢，隨時監視壓力表及流量計小心調節，停車時也不可過速，并及時打開放空門，不使電滲析器本體受負壓。