(1）結垢 有些低溶解度鹽類，在反滲透器濃縮時，可能超過其溶度積而析出，沉淀下來。造成沉積物在膜面上及進水通道上形成垢。
( 2)金屬氧化物沉積 水源中的鐵、鋁腐蝕產物，預處理凝聚劑中的亞鐵或鋁離子，系統中鐵的腐蝕產物沉積在膜面及進水通道。
(3）生物污泥的形成 微生物喜在浸于不含殺菌劑水中的物體表面上生長。當膜面上覆蓋有微生物污泥時，膜所除去的鹽類將陷于泥層中，不容易被進水沖走，使膜 的性能變壞。如有垢在粘泥中形成，則膜可能完全不起作用。生物污泥還會使醋酸纖 維素發生生物降解，使膜的醋酸化度減少，脫鹽率大大下降。
以下是防止膜元件的污染幾點措施
(1)對原水進行預處理，降低水中懸浮物及有機物含量。
(2)調節進水PH值，保持水的穩定性，防止膜面上形成垢。
(3)防止濃差極化。
(4)對膜進行定期清洗。
(5)停用時做好停運保護工作。
(6)定期對膜元件進行更換。