目前電滲析設備在海水或苦咸水淡化和某些工業用水的精制等應用中都已有大型裝置投入生產性運行，而在廢水處理中的應用還相對較少，應注意以下三點：
1、在給水處理中應用的電滲析器，只回收淡水和只關注淡水水質，水的回收率一般為50%～70%；而應用電滲析處理廢水時，有時淡水和濃水均可回收利用，水的回收率高，有時濃水的利用價值高于淡水。
2、在給水處理中應用的電滲析器只含有陽膜和陰膜，并以膜對的形式存在，而在廢水處理中，電滲透析器用膜的種類較多，有陽膜、陽膜、中性膜和復合膜等，根據處理對象組成和處理目的的不同而有不同的膜組合形式。
3、在給水處理中，關注電滲析電極反應多半是為了防止電極反應的負面影響，而在廢水處理中，有時是利用電極反應來達到處理廢水和回收有用物質的目的。