全自動軟化器交換樹脂受污染的原因，大體上有如下幾種：
①有機物污染。有機物是污染離子交換樹脂，特別是強堿性陰樹脂的主要雜質。有機物分子量一般都較大，特別是腐殖質酸，它對樹脂的污染主要有兩種形式。一是有機物的羧基與樹脂活性基團的結合;二是有機物依靠分子與分子間的引力，吸附在離子交換樹脂上。有機物對樹脂的污染，會降低其對離子的交換能力。
②油類污染。油類雜質能堵塞離子交換樹脂的微孔，使這些微孔中的活性基團不能進行離子交換，從而降低了樹脂的工作交換容量。油質的來源，多半是由于操作不慎或設備有漏油而造成的。
③懸浮物污染。水中懸浮物微粒會包圍在離子交換樹脂的顆粒表面，從而隔絕了樹脂的離子交換過程，使樹脂受到污染。這種污染以陽床樹脂為嚴重。
④高價金屬離子產生的污染。高價金屬離子會由于混凝處理操作不當或設備腐蝕，而隨入床水進入交換床。由于這些高價金屬 離子與樹脂間有較高的交換能力，因而被牢固地吸附在離子交換樹脂上，并不易被再生“洗脫”下來，因而使樹脂失去交換作用。這種高價金屬離子對交換樹脂的污染，有些稱這種現象為“重金屬中毒”。
⑤再生劑不純產生的污染。如果再生劑不純，其中混有許多雜質(如氫氧化鈉中就常有NaCI或鐵化物等雜質)，從而對樹脂產生污染。
離子交換樹脂收到污染后，通常會有以下幾種現象：
①樹脂顏色發生變化。通常由黃色變為深棕色或黑色
②樹脂的交換容量明顯下降。表現為交換床周期制水量明顯減少。
③出水水質惡化。表現為出水pH值降低，電導率升高，“漏鈉”、“漏硬”和“漏硅”出水量明顯增大。
④再生單耗上升。
⑤清洗時間延長，清洗水量增加。